When I think about virtual approaches to life science research, all I can say is — This is the way!

生物蛋白的应用：基于Discovery Studio程序包对蛋白质的降解

本文利用Discovery Studio程序包实现基于配体的药效团的生成和药效团建模，实现新型FXR受体兴奋剂的筛选研究

使用COSMO-RS方法和分子互补性(MC)方法做为组合判据，显著提高共晶配体的筛选效率。

现代药物设计过程包括基于计算方法发现、研究和修饰生物活性分子。计算机辅助药物设计减少了药物设计周期中的迭代次数，并加快发明和优化过程。此外，它还提供了药物设计过程中发现更新颖的小分子结构的潜力。由于它基于量子化学，因此COSMOlogic软件可广泛应用于整个有机化学领域。用户可以将其应用于截然不同的新颖化学领域。COSMOsim3D和COSMOsar3D使用本地σ-profiles作为描述符。σ-profiles是从量子化学计算得出，描述分子电子表面的特性，而不是化学结构。因此，它们自然允许支架跳跃和寻找活性类似物。本地σ-profiles提供有关以下信息：●静电势●氢键能●疏水相互作用●形状排列和活性相似体搜索使用基于量子化学的分子表面极性，COSMOsim3D是独特的、稳定的基于场的配体-配体比对的方法。COSMOsim3D相似性是配体相似性的有力描述。因此能够在生物等排体和随机对之间进行良好的区分，并允许支架跳跃和寻找活性类似物。ExampleforbioisosterscreeningwithCOSMOsim3D(PDF)3D-QSAR局部σ-profiles阵列是一组新颖的分子相互作用场。他们提供了量化虚拟配体-受体相互作用（包括去溶剂化）所需的所有信息。这导致3D-QSAR研究的预测准确性提高，并且在网格步长、网格定位和随机未对准方面具有出色的稳定性。ExampleforthepredictivityofaCOSMOsar3Dbased3D-QSARincomparisontoothermethodsontheSutherlanddataset.(PDF)ADME属性COSMOtherm或COSMOquick中，分子描述符可从表面极性信息和结构参数中得出。用户可以基于这些有明确物理意义的描述符来构建自己的QSAR模型。许多此类ADME模型可直接使用。

药物开发是一种开发新的药物有效成分的高效合成、纯化和结晶方法的艺术，该方法的局限性在于仅具有少量且极其昂贵的可用物质，并且面专利时钟的时间压力。在这种情况下，计算筛选可能会非常有益。共晶筛选通过API的共晶来优化药物性能和规避专利已成为药物开发的重要分支。COSMOquick工具提供了一种快速的工具，根据给定API的共晶可能性对潜在的共晶形成物的庞大列表进行排序，并且还可以对所得的溶解度进行粗略估算。溶解度筛选溶解度通过药物释放过程中的溶解作用影响结晶、共晶体或溶剂化物的形成，以及药代动力学。使用COSMOtherm，可以预测纯化合物、共晶体和混合物在几乎无限范围的溶剂和溶剂混合物中的溶解度。优化溶剂以进行萃取或下油加工是COSMOtherm的关键应用之一。相平衡COSMOtherm提供了广泛的方法来解决液相、气相和固相之间的相平衡问题。用户甚至可以以简单明了的方式为复杂的任务建模。萃取和纯化只是两个潜在的应用。反应将TURBOMOLE的高级量子化学方法与COSMOtherm的溶剂化自由能预测相结合，研究反应机理。可以以半定量的方式预测平衡常数、甚至动力学常数。使用这种方法可以轻松选择反应的最佳溶剂。 在我们的反应白皮书中了解更多信息WhitePaperonreactions。